Sí, en la plantilla de Excel, debes colocar el mismo número de guías a los ítems que corresponda.  A continuación un vídeo ilustrativo:

Importante: La única manera que el número de guía, documento o factura se repita es debido a que un cliente solicite varios productos en su despacho, ya que contiene la misma información como dirección de destino y datos del cliente.